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CLIPP - CLinical Innovation Proteomic Platform

Prestations

  • Activités Analytiques par Spectrométrie de masse Production de biopuces à façon : Or, SiOx, TiO2, AsGa
  • NanoCaractérisation des surfaces et biointerfaces (microscopie à force atomique couplée à la fluorescence)
  • Fonctionnalisation biopuces : Protéines, ADN, Aptamère, nanobodies, anticorps, petites molécules, annexine, ...
  • Micro/nanostructuration de surface
  • Traitement enzymatique de surface (IMAG PREP) pour analyses biopuces ou coupes tissulaires
  • Mesure d'interaction moléculaire temps réel : Surface Plasmon Resonnance (SPR) et SPRi
  • Utilisation des biopuces pour capture et analyse de cellules, microparticules biologiques, globules rouges
  • Quantification après capture par MS et/ou AFM
  • Qualification métrologique des objets capturés par microscopie à force atomique (AFM)
  • Expression hétérologue de protéines (membranaires) dans des bactéries en vue de leur caractérisation fonctionnelle et structurale

Contact: Céline Elie-Caille

  • Identification et caractérisation de protéines recombinantes
  • Identification, caractérisation de cibles protéiques (analyses multiplexes) dans des échantillons complexes (fluides biologiques, extraits cellulaires...)
  • Identification de complexes protéiques et/ou de partenaires de protéines cibles
  • Enrichissement de phosphoprotéines et/ou phosphopeptides
  • Recherche de modifications : méthylation, ubiquitination, hydroxylation, oxydation, phosphorylation... sur protéines recombinantes purifiées
  • Qualification, caractérisation et quantification des différents lots de production de protéines
  • Recherche de protéines contaminantes (drogues produites par biosynthèse)
  • Analyse protéine entière, mesure de masse exacte (ESI)
  • Création de bases de données spécifiques pour des protéines recombinantes inexistantes dans les banques de données
  • Développement de méthodes et de préparation/analyses d'échantillons haut débit

Contact:

  • Création de bases de données spécifiques pour microorganismes
  • Identification de microorganismes (analyse en routine avec les établissements de santé)

Contact:

  • Analyses statistiques pour la sélection de marqueurs diagnostiques ou pronostiques dans le cadre de données de grande dimension
  • Analyse statistique de données de spectrométrie de masse de type ESI–Orbitrap et MALDI depuis le prétraitement jusqu'à la sélection de marqueurs d'intérêt
  • Détermination du plan expérimental en amont des analyses (calcul de puissance)

Contact:

  • Visualisation et compréhension des interactions protéiques
  • Aide aux partenaires pour le choix de cibles protéiques

Contact:

Norme qualité

LogoCertificat-ISO9001SATTGE 2

Université de Bourgogne