Outils biostatistiques et bioinformatiques adaptés à l’analyse des données à grande dimension
Applications
- Analyses statistiques pour la sélection de marqueurs diagnostiques ou pronostiques dans le cadre de données de grande dimension
- Protéome, transcriptome, génome
- Données autres: agronomiques, imagerie, etc...
- Analyse statistique de données de spectrométrie de masse de type ESI–Orbitrap et MALDI depuis le prétraitement jusqu'à la sélection de marqueurs d'intérêt
- Détermination du plan expérimental en amont des analyses (calcul de puissance)
- Visulation et compréhension des interactions protéiques
- Aide aux partenaires pour le choix des cibles protéiques
Développements
- Optimisation des plans d’expérience
- Pré-traitement des données de protéomique
- Etude de la puissance et de la reproductibilité des études de protéomique clinique